พญานาคิน สโมสรฟุตบอลลูกอีสาน ก่อตั้งขึ้นเมื่อวันที่ 6 พ.ย.2552 เกิดจากกลุ่มชาวอีสานที่ย้ายมาอยู่ใน เมืองใหญ่ อย่างกรุงเทพมหานคร เพื่อเข้ามาทำงาน เรียนหนังสือ หรือการย้ายถิ่นฐานมา แต่ทุกคนต่างมีใจรักฟุตบอล และรักความเป็นลูกอีสาน ซึ่งในปัจจุบัน นักเตะสายเลือดอีสาน ได้เข้าไปสร้างชื่อเสียงให้กับทีมต่างๆ ซึ่ง ในขณะนี้ยังไม่มี ทีมฟุตบอลใดที่สามารถเป็นศูนย์รวมของเหล่า ผู้ที่รักและชื่นชอบในความเป็นลูกอีสาน จึงทำให้เกิดแนวคิดว่าควรจะมีทีมของชาวอีสาน จริงๆ เสียที จึงได้มีการก่อตั้งสโมสรฟุตบอลขึ้น โดยมีแนวทาง ของสโมสรทีมฟุตบอลลูกอีสาน จะเน้นในการสนับสนุนนักฟุตบอลจากภาคอีสาน เป็นหลักเพื่อสร้างงาน สร้างอาชีพให้กับเยาวชน และผู้ที่สนใจทางด้านการกีฬาฟุตบอล และยกระดับให้กับมาตรฐานของฟุตบอลไทยในปัจจุบัน

เพื่อเพิ่มคุณค่าให้แก่สังคม สโมสรจะเปิดโอกาสให้แก่เด็กที่มีฐานะค่อนข้างขัดสน ตามชนบทหรือต่างจังหวัด ได้มีโอกาสที่จะเรียนรู้และเล่นกีฬาฟุตบอล เพื่อให้เด็กกลุ่มนี้มีชีวิตที่ดีขึ้นในด้านกีฬาฟุตบอล สามารถเป็นทั้งนักกีฬาฟุตบอลมืออาชีพ พนักงาน หรือ ผู้ตัดสินฟุตบอล นอกจากนี้ ในอนาคตสโมสรมีโครงการที่จะมอบทุนการศึกษามอบให้กับผู้เล่นที่มีความสามารถ ทั้งนี้สโมสร ได้มุ่งเน้นการมีส่วนร่วมของกลุ่มสมาชิกที่มีความสุข ความซื่อสัตย์ ความหลงใหล และอาสาสมัคร ผู้ชื่นชอบ เพื่อสนับสนุนทีมฟุตบอลลูกอีสานให้พัฒนาต่อไปในอนาคต